پویش ژنومی جهت شناسایی مناطق ژنومی موثر بر نرخ دو قلوزایی گوسفندان نژاد بلوچی با استفاد از الگوی عدم تعادل لینکاژی
thesis
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه مازندران - دانشکده کشاورزی
- author محسن قلی زاده
- adviser اردشیر نجاتی جوارمی قدرت رحیمی میانجی
- publication year 1392
abstract
دوقلو زایی از صفات مهم اقتصادی در پرورش گوسفند می باشند. صفات تولید مثلی نه تنها در بین نژادهای مختلف گوسفند بلکه در بین گوسفندان یک نژاد نیز دارای تفاوت های عمده می باشند. در این تحقیق مطالعه ارتباط ژنومی با استفاده از 42416 نشانگر تک نوکلئوتیدی برای شناسایی نواحی ژنومی موثر بر نرخ دو قلوزایی در گوسفند بلوچی انجام شد. نمونه های خون از 96 راس گوسفند بلوچی همراه با داده های فنوتیپی زایش متعلق به دو گله از ایستگاه تحقیقاتی عباس آباد تهیه شد. نمونه ها با استفاده از ریز آرایه های نانویی گوسفندی (50k) تعیین ژنوتیپ شدند. با استفاده از نرم افزار plink ماتریس خویشاوندی ibs برای افراد محاسبه شد. مطالعه ارتباط ژنومی برای نرخ دو قلوزایی و تعداد کل بره ها در مجموع 4 شکم زایش با در نظر گرفتن بعد اول آزمون mds و اثر گله به عنوان کووریت انجام شد. برای کنترل نرخ اشتباه در سطح خانواده، از تصحیح بنفرونی استفاده شد و آزمون ارتباط به کمک نرم افزار plink انجام گرفت. ارتباط معنی دار برای دو نشانگر روی کروموزوم 10 و 15 شناسایی شد که تعداد کل بره ها را تحت تاثیر قرار دادند. qtl های پیشنهادی برای نرخ دو قلوزایی در شکم زایش های مختلف نیز روی همین دو کروموزوم شناسایی شدند. نتایج این پژوهش نشان می دهد که انجام مطالعات بیشتر روی کروموزوم های مذکور کمک شایانی در جهت شناسایی ژن های کاندید موثر بر نرخ دو قوزایی در گوسفندان نژاد بلوچی خواهد داشت.
similar resources
بررسی الگوی عدم تعادل لینکاژی و مطالعه ارتباط ژنومی هاپلوتیپی جهت شناسایی مناطق ژنومی موثر بر دو قلوزایی در گوسفندان نژاد بلوچی
Twinning trait is an important trait in sheep breeding. Reproductive traits differ greatly across sheep breeds, but also between sheep in a single flock. Identification of ewes with higher twinning rate and more raised lambs per year is an important parameter for breeding and farming success. A genome-wide haplotype association study, using 42,416 Single Nucleotide Polymorphisms (SNPs) was cond...
full textبررسی الگوی عدم تعادل لینکاژی و مطالعه ارتباط ژنومی هاپلوتیپی جهت شناسایی مناطق ژنومی موثر بر دو قلوزایی در گوسفندان نژاد بلوچی
دوقلوزایی از صفات مهم اقتصادی در پرورش گوسفند میباشند. صفات تولیدمثلی نه تنها در بین نژادهای مختلف گوسفند بلکه در بین گوسفندان یک نژاد نیز دارای تفاوتهای عمده میباشند. در این تحقیق مطالعه الگوی عدمتعادل لینکاژی و ارتباط ژنومی هاپلوتیپی با استفاده از 42416 نشانگر تکنوکلئوتیدی برای شناسایی نواحی ژنومی مؤثر بر نرخ دوقلوزایی در گوسفند بلوچی انجام شد. نمونههای خون از 96 رأس گوسفند بلوچی همرا...
full textشناسایی مناطق ژنومی مرتبط با صفات تولیدمثلی در گوسفند بلوچی با استفاده از نشانگرهای با تراکم بالا
در این تحقیق، یک پویش ژنومی برای شناسایی جایگاههای مؤثر بر صفات تولیدمثلی در گوسفند بلوچی انجام شد. به این منظور، نمونهبرداری خون از 96 رأس میش همراه با دادههای فنوتیپی مربوط به صفات تولیدمثلی شامل مجموع وزن همزادان متولد شده، میانگین وزن همزادان در تولد، مجموع وزن همزادان شیرگیری شده، میانگین وزن همزادان شیرگیری شده و تعداد برههای زنده در شش ماهگی در چهار نوبت زایش بدست آورده شد. پس از اس...
full textبررسی SNPهای مرتبط با چربی لاشه در گوسفندان نژادهای افشاری، مغانی و قزل
شناسایی مناطق ژنومی کنترل کننده صفات اقتصادی، یکی از چالش برانگیزترین موارد استفاده از نشانگرهای متراکم در ژنتیک حیوانی است. شناسایی جایگاههای ژنی مرتبط با ذخیره چربی از لحاظ اقتصادی از اهمیت زیادی در پرورش گوسفند برخوردار است. در این تحقیق، از تعداد 49034 نشانگر تک نوکلئوتیدی برای شناسایی نواحی ژنومی موثر بر ذخیره چربی برای 106 رأس گوسفند از نژادهای افشاری (37)، مغانی (34) و قزل (35) استفاده ...
full textبررسی الگوی عدم تعادل پیوستگی در سه نژاد از گوسفندان بومی ایران
شناخت الگوی عدم تعادل پیوستگی در جمعیتهای مختلف اطلاعات سودمندی برای بررسیهای انتخاب ژنومیک (ژنومیک) (GS) و پویش ژنوم یا ژنوم (GWAS) و شناخت معماری ژنتیکی صفات از طریق بررسی فاز پایداری عدم تعادل پیوستگی بین نشانگر و جایگاه صفت کمی فراهم میکند. هدف از این پژوهش بررسی عدم تعادل پیوستگی در سه نژاد از گوسفندان بومی ایران (بلوچی، لری-بختیاری و زل) است. بدین منظور از 186 نمونه گوسفند (شامل 96 نمو...
full textتجزیه و تحلیل غنیسازی مجموعههای ژنی با استفاده از مطالعات پویش کل ژنومی جهت شناسایی ژنها و مسیرهای مرتبط با تعداد نتاج در نژادهای مختلف گوسفند
هدف از این پژوهش، بررسی صفت تعداد نتاج در هر زایش میش بهعنوان یک صفت تولیدمثلی مهم بود. بدین منظور از رکوردهای فنوتیپی هفت نژاد گوسفند وادی، هوی، ایسلندی، فینشیپ و رومانوف با باروری بالا و نژادهای تکسل و راهمنی با باروری پایین، برای مطالعه پویش ژنومی بر پایه آنالیز غنیسازی به منظور شناسایی مکانیسمهای زیستی استفاده شد. ارزیابی پویش کل ژنومی در بسته GenABEL برنامه R انجام شد. آنالیز غنیساز...
full textMy Resources
document type: thesis
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه مازندران - دانشکده کشاورزی
Keywords
Hosted on Doprax cloud platform doprax.com
copyright © 2015-2023